一覧
| 話数 | サブタイトル | 主な内容 |
|---|---|---|
| 第1話 | 漂流?冒険の島! | ファイル島編突入。太一たち「選ばれし子供たち」はデジモンに遭遇する。 |
| 第2話 | 爆裂進化!グレイモン | アグモンがグレイモンへ初進化。 |
| 第3話 | 蒼き狼!ガルルモン | ガブモンがガルルモンへ初進化。 |
| 第4話 | 灼熱!バードラモン | ピヨモンがバードラモンへ初進化。 |
| 第5話 | 電光!カブテリモン | テントモンがカブテリモンへ初進化。 |
| 第6話 | パルモン怒りの進化! | パルモンがトゲモンへ初進化。 |
| 第7話 | 咆哮!イッカクモン | ゴマモンがイッカクモンへ初進化。 |
| 第8話 | 闇の使者デビモン! | デビモン、オーガモン、レオモン初登場。子供たちが分断される。 |
| 第9話 | 激突!冷凍デジモン | ユキダルモン、モジャモン初登場。 |
| 第10話 | 守護者ケンタルモン! | ケンタルモン初登場。 |
| 第11話 | 踊る亡霊バケモン! | |
| 第12話 | 冒険!パタモンと僕 | エレキモン初登場。 |
| 第13話 | エンジェモン覚醒! | パタモンがエンジェモンへ初進化。 |
| 第14話 | 出航(たびだち)・新大陸へ! | ゲンナイ初登場。 |
| 第15話 | エテモン!悪の花道 | エテモン編突入。 |
| 第16話 | 暗黒進化!スカルグレイモン | アグモンがスカルグレイモンへ暗黒進化。みんなのトラウマ回。 |
| 第17話 | 幻船長コカトリモン! | |
| 第18話 | 妖精!ピッコロモン | ピッコロモン初登場。 |
| 第19話 | 迷宮のナノモン! | ナノモン初登場。 |
| 第20話 | 完全体進化!メタルグレイモン | アグモンがメタルグレイモンへ初進化。 |
| 第21話 | コロモン東京大激突! | 太一はコロモンと共に人間界へ。八神ヒカリ初登場。細田守演出回。 |
| 第22話 | ささやく小悪魔ピコデビモン | ピコデビモン初登場。 |
| 第23話 | 友よ!ワーガルルモン | ガブモンがワーガルルモンへ初進化。 |
| 第24話 | 激突!アトラーカブテリモン | テントモンがアトラーカブテリモンへ初進化。 |
| 第25話 | 眠れる暴君!トノサマゲコモン | |
| 第26話 | 輝く翼!ガルダモン | ピヨモンがガルダモンへ初進化。 |
| 第27話 | 闇の城ヴァンデモン | |
| 第28話 | 追撃!日本へ急げ | 選ばれし子供たちは人間界に帰還する。 |
| 第29話 | マンモン光が丘大激突! | 人間界編に突入。 |
| 第30話 | デジモン東京大横断!! | |
| 第31話 | レアモン!東京湾襲撃 | |
| 第32話 | 熱いぜ東京タワー!デスメラモン | |
| 第33話 | パンプとゴツは渋谷系デジモン | |
| 第34話 | 運命の絆!テイルモン | テイルモン、ウィザーモン初登場。 |
| 第35話 | お台場の妖精!リリモン開花 | パルモンがリリモンへ初進化。 |
| 第36話 | 結界突破!ズドモンスパーク | ゴマモンがズドモンへ初進化。 |
| 第37話 | 完全体総進撃!きらめくエンジェウーモン | テイルモンがエンジェウーモンへ初進化。ウィザーモン退場。 |
| 第38話 | 復活!魔王ヴェノムヴァンデモン | |
| 第39話 | 二大究極進化!闇をぶっとばせ!! | アグモンがウォーグレイモンへ、ガブモンがメタルガルルモンへ初進化。 |
| 第40話 | 魔の山の四天王ダークマスターズ | ダークマスターズ編突入。ダークマスターズ初登場。ピッコロモン退場。 |
| 第41話 | 荒ぶる海の王!メタルシードラモン | |
| 第42話 | 沈黙の海底ホエーモン | ホエーモン退場。メタルシードラモン退場。 |
| 第43話 | 危険な遊戯!ピノッキモン | |
| 第44話 | 迷いの森のジュレイモン | 太一とヤマトが対立。 |
| 第45話 | 究極体激突!ウォーグレイモン対メタルガルルモン | ホメオスタシス登場。ヤマトが単独行動に。 |
| 第46話 | メタルエテモンの逆襲 | エテモンがメタルエテモンに覚醒して復活。 |
| 第47話 | 風よ!光よ!サーベルレオモン | レオモンがサーベルレオモンに覚醒して登場するが、退場。メタルエテモン、ピノッキモン退場。 |
| 第48話 | 爆撃指令!ムゲンドラモン | ヒカリが風邪をぶり返してしまう。 |
| 第49話 | さらばヌメモン | ムゲンドラモン退場。 |
| 第50話 | 女の闘い!レディデビモン | エンジェウーモンvsレディデビモンのキャットファイト回。 |
| 第51話 | 地獄の道化師ピエモン | |
| 第52話 | 聖剣士!ホーリーエンジェモン | パタモンがホーリーエンジェモンに初進化。ピエモン退場。 |
| 第53話 | 最後の暗黒デジモン | アポカリモン初登場。 |
| 第54話 | 新たな世界 | 最終回。 |
