城	城主	忍者	仲が悪い城	備考
アミタケ城	網茸竹武(77)→編武		ドクタケ	隣国ナラタケの姫(60)と結婚し同盟関係に。ドクササコと関わりがある暗殺者が侵入。
エゴノキタケ城			スッポンタケ-サンコタケ-ドクタケ	チャミダレアミタケと仲が良い
エノキ城			ドクタケ	侍-橋本新九郎がナメコ城への和議状を届ける任を受ける。ドクタケと交戦中。
キクラゲ城	木耳持兼(99)、良兼(若様)	頭/源内三衛門/加場出居介-場潟右衛-楽呂須太夫-灰木勇-村名琴頼	トフンタケ	トフンタケから忍者が潜入しキクラゲを混乱させるが、正社員忍者は定時で帰宅するため定時以降は役立たず、安月給の派遣忍者の方が仕事量が多く有能。侍大将・大川深ヱ門に、ホテイタケ城主から密書。若様(67)と家来・常光寺与ヱ門による盗賊の角魂党退治(退治出来たら家督を譲る)に乱きりしんが協力し友達に。
チャミダレアミタケ城	茶乱網武	元・スッポンタケの刺客とくの一三人他	スッポンタケ-サンコタケ-ドクタケ	戦に強いのでチャミダレアミタケを邪魔に思っている城は多い。命を狙ってきた刺客を赦し、城で雇うなど城主は懐が広い。敵の忍者がチャミダレアミタケが強い理由に納得した場面も。城主は灰洲井溝に城兵のコーチを頼んだ。
ツルタケ城	大場花門	亀甲万太夫/内木小丸	ヒラタケ	亀甲万太夫は学園長先生の先生。
鶴の巣城			クモの子	クモの子城との戦で若君を人質に取られたが、後に若君は解放された。
ナメコ城	在庫忠安		ドクタケ	長い間戦してきたエノキ城と和議を結ぶ。
ナラタケ城			ドクササコ-ドクタケ	姫(60)が侍の大辺穀造を供にし、アミタケ城城主(77)に嫁ぐ
ベニタケ城	赤沼紅武	細井万丸		凄く山奥にある小さな城。
マイタケ城	佃弐左衛門	天座毛粕十郎	ナルト	ナルトと交戦中。ナルトやドクダケに領地を狙われており、城主暗殺未遂もあった。忍術学園と仲良しで学園長が天座毛を紹介。天座毛が来るまで忍者がいなかった

忍術学園と仲の悪い城

城	城主	忍者	評判	仲が悪い城	備考
ウスタケ城		ゴールド免許の長老/仮免忍者赤ヒゲ-ウードン白茸		ヒダハタケ	タカ丸の祖父(幸丸)はこの城の忍者(穴丑)で、ウスタケはドクササコに抜け忍の斉藤親子の暗殺を依頼。
オーマガトキ城	大間賀時曲時	射場亨/貝原太郎-『町の忍術塾』卒業の忍者二人	×	カワタレドキ・タソガレドキ	城主が情報の重要性を分かっておらず(戦下手)、忍者は足軽を命令で忍者にしたり、アルバイトで雇った農民などヘボばかり。タソガレドキの属国に。増税して戦の準備中。
オシロイシメジ城			×		あちこちの城に戦を仕掛け領地を奪う悪い城。大安宅船の設計図も狙った。水軍と手を組もうと必死。
カワキタケ城		辺野茂平次			ここの忍者は敵地に侵入する時は全員辺野茂平次の顔に変装する。
クサウラベニタケ城		油片武羅-樫尾平哉	×		ホテイタケの密書を狙った。安宅船の設計図を狙った。
クモの子城	鬼瓦只安	宇奈月十太夫(その後転職)		鶴の巣	鶴の巣と交戦中。鶴の巣の若君を人質に取った。乱きりしんが入学後最初に忍び込んだ城。
サンコタケ城		ヘッポコ忍者しかいない	×	エゴノキタケ-ドクタケ-チャミダレアミタケ	好戦的な城。スッポンタケと仲が良いが、エゴノキタケと敵対するスッポンタケが一時的に手を結んでいるだけ。チャミダレアミタケ城主を暗殺しようとした。
ショウロ城	常磐兼成	ホオズキ丸(その後ドクタケに転職)	×		城主が、六道辻ヱ門の家宝を横取り。
スッポンタケ城		頭/チャミダレアミタケ城主暗殺の刺客とくの一は、スッポンタケの忍軍による霞扇の術を仕掛ける時見捨てられ危うく殺されかけ、チャミダレアミタケに寝返り、茶乱網武の護衛として転職。-コオロギ足眉の忍者-新人ヘボ忍者たち	×	チャミダレアミタケ-エゴノキタケ	サンコタケと手を組みエゴノキタケに対抗。チャミダレアミタケの城主の暗殺を二度も企んだ。タカ丸の父・斉藤幸隆が代官館(代官-馬場丹後乃介:お茶が好き)に髪結いとして出入りしている。ドクササコと手を組む。ヘボ忍者ばかりだが数は多い。非情な城なので抜け忍も多い。味噌は塩分控えめ。
タソガレドキ城	黄昏甚兵衛	雑渡昆奈門/山本陣内-高坂陣内左衛門他	×	オーマガトキ-アカトキ-ドクタケ	カワタレドキと手を結びたいが上手くいかない。オーマガトキの宗主国。
ドクアジロガサ城		市之助(毎度多田常禅の弟子の山左ヱ門の変装をする),他	×		汚い手を使うことで有名な悪い城。多田堂禅が作る新型砲弾や忍術学園の火薬を狙う。雑兵が集まらず軍の編制がままならない。当面戦は出来ない。力押しで戦するタイプ。手の込んだ作戦は考えない。忍者は優秀。
ドクササコ城	毒笹子市村	凄腕忍者/草井兵四郎-八味地黄丸-ドす部下-亀山鶴蔵(元・ドクタケ城五の城の守備隊長)-太郎-次郎	×	ナラタケ	戦好きな悪い城。ウスタケ、ドクタケと仲が良い。多くの城と敵対。戦続きで兵糧や物資が不足気味。複数の土倉を騙し資金を調達。
ドクタケ城	木野小次郎竹高	稗田八方斎/ドクタケ六人衆，他	×	沢山	給料が良い。兵庫水軍とも敵対関係。
トフンタケ城		斗奪四郎志兵衛/切羽拓郎(トフンタケ一の忍者・現実的)-天日文津丸	×	キクラゲ	キクラゲを内部から混乱させるために潜入。土倉の抜天坊の財産を横領するために奉公人に変装し潜入。戦の準備を進めている。土井先生の出席簿を投げ棍棒で真っ二つにへし折った。
ナルト城	原伊丹之守若元	毒掃丸/女装が上手く女声の忍者(30期39話)	×	マイタケ-ドクタケ	久々知兵助は夏休みの宿題でこの城の軒丸瓦を取って来た。力押しで戦するタイプ。手の込んだ作戦は考えない。忍者は優秀。
ヒラタケ城		脂足の足が臭い忍者-歩き方が悪く調子っぱずれの忍者	×	ツルタケ	忍者二人の忍者としての腕は悪くはないが…。
×ホウキタケ城				オニタケ-ドクタケ	早すぎた天才がお金を持ち出して抜けた城。変装が下手なくせに自分たちで化けようとする。
ヤケアトツムタケ城		愛妻弁当持参忍者	×		ドクタケと仲が良い。海を支配しようと企む。海の妖怪や魔物に詳しい。軍船の設計図を狙う。兵庫水軍と敵対関係。

忍術学園と仲が良くも悪くもない城

城	城主	忍者	評判	仲が悪い城	備考
カラスタケ城		カラスタケのじょん	×	エノキタケ-ドクタケ	ヘッポコ忍者しかいない。忍者隊部隊長が学園長の元教え子。
カワタレドキ城	香波垂時衛門	『町の忍術塾』卒業の忍者二人(後に転職)-満念平乃介(派遣)		オーマガトキ-ドクササコ	タソガレドキ城の川向こうにある城。城主が南蛮衣装に凝っている。忍び装束の裏がオーマガトキの忍び装束と同じ色。増税して戦の準備中。羽丹羽石人の父親が仕えている(武士)。忍者がいない城
オニタケ城		春牧行者/西長洲本通九丁目-風の玉三郎		ホウキタケ-ドクタケ

それ以外の城

城	城主	忍者	仲が悪い城	備考
アカトキ城			タソガレドキ
シイタケ城				シメジ城から届くはずだった密書は届かなかった
シメジ城				シイタケ城に密書を届けるはずだったが、忍者が迷子になった上に、密書をなくしてしまった
セミタケ城			マツホド	70年前の『バフン岳の戦い』マツホドに勝利したが、20年前ドクダケに滅ぼされた。
タケノコ城				山田という家臣が何者かに命を狙われていた。方向音痴の殺し屋が忍術学園の山田先生をタケノコ城の『山田』と間違えて襲った。
ヒダハタケ城			ウスタケ	ウスタケの兵が陣取るカワタケ村に攻め込み勝利。小松田秀作が忍者隊の就職試験に応募した城。毒キノコなグレーゾーンな城。
ホテイタケ城	布袋岳九度成	手の形眉の忍者-凄い睫毛の忍者		忍術学園の武道大会を見学に来た
マツホド城		浜守一郎の曾祖父他(失業)	セミタケ	元マツホド城の支城だったホドホド城は、70年前にセミタケに滅ぼされ(一夜の戦闘で落城。当時忍者隊は本城にいた)幽霊城の噂が立つ(ホドホド城は戦略上重要な位置にあり、タソガレドキが密かにここに兵糧を備蓄していた)。本城のマツホド城も『バフン岳の戦い』でセミタケに敗れ落城

アニメオリジナルの城

城	城主	忍者	仲が悪い城	備考
キノコ裏々山にある城(名称不明)	城主名不明	不明(密書を侍が届けようとしていたから忍者隊はない？)	ドクダケ	この城の若殿様は浦風藤内に瓜二つで、かなり迂闊な性格※

※27期19話『危険な予習?の段』、29期『三年生のピクニックの段』に登場。27期では藤内と数馬に助けられ、29期では三年生と立花先輩、食満先輩、竹谷先輩に助けられた。どちらも藤内が若殿様と服を取り換えて囮(身代わり)に。

忍ミュオリジナルの城

城	城主	忍者	仲が悪い城	備考
カエンタケ城		カエンタケ忍者隊

関係

忍術学園との関係

基本的に、食用不可な毒キノコの名前が付いている城が悪い城で忍術学園とも敵対関係、食用可能なキノコの名前の城が良い城だが、例外もある(例：スッポンタケは食用可能だが、見た目のグロテスクさから作者が毒キノコと勘違いして付けてしまったらしい。なのでスッポンタケ城は悪い城)。またキノコの名前ではない城もいくつかある。

キノコ名以外の城の名前の由来

カワタレドキ：彼は誰時→彼は誰、とはっきり見分けられない時分。主に明け方を指す。

タソガレドキ：誰そ彼時→夕方の薄暗い時を指す。

オーマガトキ：逢魔が時→日が暮れて闇夜が訪れる時間帯を意味する。「大禍時」と表記する場合もある。魑魅魍魎に出会う禍々しい時とされる。

城同士の関係

キクラゲ城、マイタケ城、アミタケ城、ナラタケ城、チャミダレアミタケ城は、城主、姫や若君、もしくは忍者隊や従者と乱きりしんが友達。忍術学園と仲良し。

タソガレドキは城主が戦好きな悪い城だが、忍軍は保健委員会の善法寺伊作に恩があり、戦に忍術学園が関わっても手は出さず、時には手助けしてくれる。一年ろ組の鶴町伏木蔵が組頭の雑渡昆奈門と仲良し。

ドクタケは悪い城で忍術学園とも敵対関係にあるが、ドクたまと忍たまは仲が良い。アニメ版ではいぶ鬼と皆本金吾が仲良し。

暗殺について

茶乱網武が暗殺者に狙われている理由

チャミダレアミタケはエゴノキタケと仲が良い、だけどエゴノキタケの後ろにいるスッポンタケはエゴノキタケやチャミダレアミタケと仲が悪い。そのくせチャミダレアミタケの後ろにあるサンコタケと手を結ぼうとしている。

スッポンタケは全部自分の領土にしたい。しかしサンコタケを攻めると、その間にチャミダレアミタケやエゴノキタケに攻めこまれる。そこでとりあえずまずサンコタケと手を結び、近くの城を攻め落としてから、さらにサンコタケを攻めるつもり。（遠くと結び近くを攻める『遠交近攻』）

つまり話を整理すると、チャミダレアミタケが倒れるとエゴノキタケがスッポンタケにやられる。領地を大きくしたスッポンタケは、手を結んでいたサンコタケを攻撃するだろう。サンコタケが慌てた時にはもう遅い。後ろにいるドクタケとスッポンタケの挟み撃ちにあう。そうなると今度はドクタケがスッポンタケを攻撃するだろう。一帯が戦に次ぐ戦になってしまう。チャミダレアミタケの城主が倒れてはいけない状況。

茶乱網武は毎年恒例の紅葉狩りに出掛けるが、そこは攻めるに容易く守るに難しい地形で、そこをスッポンタケが狙ってくる。その時は護衛として剣客を雇って傍に置いている。