京阪電気鉄道9000系
京阪電気鉄道(京阪)が7200系をベースに輸送力増強を目的に1997年に投入した車両。8両編成5本が製造された。
当初は固定クロスシートとロングシートの混載のセミクロスシートで、朝ラッシュの特急や臨時特急に運用されたが、二代目3000系の導入後、新塗装化と同時にオールロングシートに改造された。
2015年以降、一部編成の8両→7両化が行われ、捻出された中間車は10000系へ編入改造されている。
阪急電鉄9000系
京阪神急行電鉄(阪急)が2006年より神宝線で運用を開始したA-trainベースの通勤型電車。先に阪急京都本線に投入された9300系と同様のデザインだが一部変更がされている。
ロングシートの8両固定編成11本が在籍。
阪神電気鉄道9000系
阪神電気鉄道(阪神)の優等用通勤型電車。阪神・淡路大震災に伴う赤胴車(阪神の優等車輌)の不足分を補うため1996年に川崎重工業で6両固定編成5本の30両が一度限り製造された。当初は画像のように赤帯だったが、現在は近鉄奈良線乗り入れ工事を実施し、オレンジの帯となった。阪神1000系と連結できる。
相模鉄道9000系
相模鉄道(相鉄)の通勤形電車。老朽化の進む大量の6000系電車を置き換えるために8000系電車と並行して1993年（平成5年）から2001年（平成13年）にかけて10両編成7本（70両）が製造された。本系列は同社の8000系よりも後に登場しているが、本系列を製造している間にも8000系を引き続き製造し、並行して導入していったことが特筆される。
西武鉄道9000系
101系の廃車発生品の足回りに新2000系の車体を乗せた西武鉄道(西武)の通勤型電車。その為、当初は抵抗制御だったが、省エネ化の為VVVFインバータ制御に改造された。西武所沢工場で製造された最後の形式。
東武鉄道9000系
東武鉄道(東武)の通勤型電車。東京メトロ有楽町線・東京メトロ副都心線・東急東横線乗り入れ用で、東武東上線を中心に活躍している。派生形式に9050系がいる。10両固定編成。
東京急行電鉄9000系
東京急行電鉄(東急)が導入した通勤形電車。東急では珍しく貫通扉は狭幅。また、一時期の東急のスタンダードとなる顔はこの車輌で始めて採用された。当初は東急東横線・東急大井町線に配属されたが、2013年の渋谷駅地下化までに東横線所属車は東急大井町線に転属し8090系を置き換え、現在は大井町線に集結。
南海電気鉄道9000系
1985年に南海電気鉄道(南海)が導入した南海本線初のステンレス車両。
近畿日本鉄道9000系
1983年に登場した近畿日本鉄道(近畿日本)の通勤型車両8810系の2両固定編成バージョン。当初は近鉄奈良線メインで運用されてきたが、転属して現在は近鉄名古屋線メインの運用に入っている。8編成在籍。
営団⇒東京メトロ9000系
←第23編成
帝都高速度交通営団(営団)が製造した通勤型車両。東京メトロ南北線の6両編成。23編成いるが、最後に製造された第22・23編成はデザインを変更した。埼玉高速鉄道や東急目黒線に乗り入れる。
京王電鉄9000系
2000年～2009年に6000系置き換えの為に京王線系統に配備された京王電鉄(京王)の通勤型電車。従来車との混結や都営新宿線乗り入れもこなす万能車両で、今では京王最大勢力になった主力車両。標準化の流れか、1000系に続き戸袋窓が廃止された。8両固定編成の0番台が8編成、10両固定編成の30番台が20編成。
