といったシリーズで類を見ないほど自分勝手に行動し、または自己中心的な考えを持つ人物が多く登場し、その殆んどがプレイヤーが納得できるような相応の罰や責任を負わないままフェードアウト。代わりに事件解決に奔走していた桐生が最後まで報われないまま後味の悪い結末を迎えるという、大団円とは程遠いシナリオに強い不快感や怒りを覚えるプレイヤーが続出し、SNSで大炎上するという事態に発展する。

その荒れ具合は凄まじく、果てには制作会社や公式SNSに直接抗議するどころか、怨嗟の声が問題の人物を演じた演者にまで向けられてしまうほど大きく荒れていた。

言うまでもないが、双方は役者/声優としての仕事をこなしただけであり、彼らを批判するのは筋違いである。

またキャッチコピーで「最後の物語」と謳っていながら真島や冴島など東城会のメインである彼らを「逮捕」という形で出番を大幅に削る、東城会の行く末を曖昧なままフェードアウトさせる、代わりに陽銘連合会や広瀬一家といった広島の極道達をメインに活躍させるという、最終作なのにも拘わらずシリーズの看板的存在である東城会の影の薄さや雑な扱いにシリーズファンたちからは難色を示されている。

それらの批判について脚本を担当した横山昌義は「シナリオへの賛否両論はあくまで狙ったもので、真摯に作品に向き合ってくれる人が多いという事がとても嬉しい」と配慮を誤った回答を返してしまい、返ってファンの怒りを買ってしまい、横山本人のみならずシリーズ総合監督・名越稔洋を初めとした開発スタッフの責任を問う声が上がるようになった。

元々『6』以前から「桐生を主人公に据えた龍が如くの物語」を構成していくことに、横山氏を始めとした開発スタッフも頭を抱えており、その悩みを時折のインタビューなどの際にセガの内外に零していたほど既に限界に達しており、期待を高まりすぎた桐生の人気に引っ張られてそのまま主人公に据え続けてしまったことが前作の『5』や今作における悲劇の一因も挙げられる。

そして、作品を重ねることに桐生の主人公としての魅力が高まり続けた一方で、作品の衰えとマンネリ化の意見も多少なりとも増え、龍が如くという作品から離れていった声も出てしまい、作品制作の上でプレイヤーに対してシリーズの期待が大きすぎるあまり限界を超え、期待に応えられず遠回しに言えば開発スタッフたちにとっても不幸だったと言える。

上述の激烈な抗議によって、セガ社内の他の部署はおろか一部の販売サイトや、批判の原因の大部分を占めるキャラクターの演者である大森南朋氏を始め芸能界側にまで多大な迷惑をかけてしまった深い反省からか、続編の『龍が如く7』やスピンオフ作品『ジャッジアイズシリーズ』のラスボス達（リンク先ネタバレ注意）はそれぞれ、同情されるべき一面を持っていたり、外道であればきちんとそれに相応するだけのケジメを与えたり、本作のラスボス程見苦しい小物っぷりは晒さない等と、極力（特にモーションも兼任している）演者のイメージに悪影響が及ぶ事がない様にキャラ設定の配慮がなされている。

それでもシナリオ構成上から恒雄のような憎まれ役がどうしても必要だったり、見ようによっては質の悪いと取られかねない劇中の行いが上記のような過剰な非難に晒されかねない場合は本業の声優を起用して演者を用いない完全造形したキャラクターに担わせている。

もう一つに長期続いた喧嘩アクションのマンネリ化を脱却するために『7』以降ジャンルはRPGへ路線変更。リメイク版及びジャッジアイズシリーズは従来のアクション路線へ方針を固めるようになった。

システム面

ほかにもシナリオ以外では「0」から好評で続いていた自由にバトルスタイルを切り替えられる戦闘システムを削除して旧作を意識したアクション、ヒートアクションの種類減少、従来からあった銃火器などのストックが出来なくなり桐生が弱体化されるなど従来の爽快感とアクションの自由度が大幅に下がる、本編に負けず劣らずのクオリティであったミニゲームやサブクエストの量がかなり削られるなどやり込み要素が従来よりも少なくシリーズをやり込み続けてきたプレイヤーからは物足りなさと不満の声が上がっている。