X	ポケモンの村にある「ななしのどうくつ」でミュウツーとの戦闘後に拾う。
Y	Yとの通信交換で入手
ORAS	グラードンorカイオーガイベント後、ミシロタウンにあるオダマキ博士の家の側で拾う。
SM	ふしぎなおくりもののあいことばで「M2DESCENT」と入力する。
USUM	バトルツリーで64BPと交換。
ピカブイ	ハナダの洞窟でブルーに勝利後、ブルーからもらう。

ウルトラサン・ウルトラムーン

クリア後イベントである「エピソードRR」では、レインボーロケット団のボス・サカキの切札であるミュウツーが、『ウルトラサン』でメガミュウツーXへとメガシンカして来る。

性能

種族値

	HP	攻撃	防御	特攻	特防	素早さ	合計	複合
ミュウツー	106	110	90	154	90	130	680
メガX	106	190	100	154	100	130	780	かくとう
上昇値	0	+80	+10	0	+10	0	+100

特攻は今までと変わらないが、攻撃が爆発的に上がった。

その攻撃は何とデオキシスアタックフォルムを上回り全ポケモン中1位。特攻の値も変わっていないので両刀も可能。

しかし、Yとの能力値の対を意識したためか上昇ボーナスのほとんどが攻撃に割かれてしまっており、他は防御面がちょっと伸びた程度で、すばやさに至っては変わらない。

タイプ一致の都合上、実はYのそれよりもはどうだんやきあいだまの威力が高い。

元がエスパータイプというのもあって当然自力ではインファイトのような高火力の物理かくとう技などなく、ポケムーバーを用いて過去作、あるいはORASの教え技でけたぐりを教えてから使用するべきであろう。

実はドレインパンチとビルドアップも習得可能なのでビルドレイン型も使用可能、メガミュウツーXは耐久も攻撃もローブシンを上回るのでこの型を使うのもありであろう。

現実の所、攻撃の高さに反してエスパー技の威力不足の問題でしねんのずつきよりもサイコブレイクの方が強く、かくとう技も半端な技よりはきあいだまの方が高ダメージだったりとステータスと技が今1つ噛み合っていない。

後に出て来るやりたい放題の伝説達に比べると、遠慮し切った特性のしょんぼり加減を含めてYとの2択という条件を含めても完全に見劣りしてしまっているのが現状である。

少なくともミュウツーが出場可能なルールという都合上、メガレックウザや他の無駄のないメガシンカ性能を抑えてPTに選ばれるということはかなり厳しい。

使用トレーナー

サカキ：レインボーロケット団ボス※

※ウルトラサン

番外作品

ミュウツー(番外作品)も参照

ポケとる

通常

2ターン周期で縦もしくは横1列をバリアとブロックに変えるというオジャマをし、かつ第5ポケモンとしてピンプクが混入している。よってノーアイテムでのクリアはほぼ不可能に近いのでフルアイテム推奨。ちなみにHPは約23000。

メガシンカ効果としては、盤面上でメガミュウツーXと同じタイプ（つまりかくとうタイプ）のポケモンを最大3匹をメガミュウツーXに変えるというもの（こいつらと同じである）。一見すると使い物にならない効果にように思えるが、3匹限定ステージろなるとその真価を発揮する（ミュウツーの数が多ければ通常ステージでも充分攻撃を与えられる）。

3匹限定ステージとなると（当然）手持ちのポケモン1匹当たりの盤面の数が多くなるため、必然的にメガミュウツーXの数も増える。つまり盤面にメガミュウツーXが大量にある際にコンボを組むと、ミュウツーの大量連鎖が起こり的にとてつもないダメージを与えられるのである。この時にルカリオやゴロンダなどで「そうこうげき」（コンボでかくとうタイプのダメージ2倍）を発動していると与えられるダメージも2倍になるためなお良し。

また、メガシンカでタイプが変わる（エスパー→かくとう）かなり珍しいポケモンである。メガシンカに必要な消去数は15個。

色違い

倒して捕獲するのはそれほど難易度は高くないが、色違いミュウツー自体がイベントポケモンであるため捕まえる機会が中々ないのが痛いところ。

メガシンカ効果としては、盤面上のメガミュウツーXを全て消すというもの。早い話がメガゲンガーと同じである。また、メガシンカに必要な消去数は12個と通常色とそれほど変わらない。

こちらも「そうこうげき」を発動した状態でミュウツーを消すと攻撃力が倍増する。

蛇足ではあると思うが、こちらもメガシンカでタイプが変わる。

漫画版

ポケットモンスターSPECIAL

12章で再登場したミュウツーがXとY2つのメガシンカを使い分けてジガルデと戦闘する。

No.		No.
0003	メガフシギバナ	0006	メガリザードン（X/Y）
0009	メガカメックス	0015	メガスピアー
0019	メガピジョット	0065	メガフーディン
0080	メガヤドラン	0094	メガゲンガー
0115	メガガルーラ	0127	メガカイロス
0130	メガギャラドス	0142	メガプテラ
0150	メガミュウツー（X/Y）