1920年に「合資会社日本運動協会」が設立されたのが始まりとされる。3年後の1923年に発生した関東大震災の震災被害により一旦解散し暫く休止状態になるが、それから11年後の1934年末に発足した「大日本東京野球倶楽部（現在の読売ジャイアンツ）を皮切りに職業野球球団が各地に次々に設立され、戦前の黄金期を迎える。この頃に米国メジャーリーグとの国内各地を回った交流試合を行っており、静岡県で行われた試合で実現した剛腕投手沢村栄治と本塁王打者ベーブ・ルースの対決は今でも語り草になっている。
太平洋戦争の拡大による国内の統制強化により､1944年に活動を休止。
職業野球人も戦地へ召集されており､前述の沢村投手を含め多数の戦死者が出た。

1945年11月に活動を復活､その4年後に2リーグ分立化が行われ、現在の日本野球機構（NPB）が成立。
戦後の経済復興と共にプロ野球も復興、1958年の「天覧試合」をきっかけに従来「遊びで金を貰っている」などと嫉妬や蔑みの目で見られていたプロ野球への評価が一転、一躍憧れや名声の対象として見られるようになり、高度経済成長期には日本における代表的なプロスポーツ団体となる。
その後昭和末期から平成中期にかけて数度の球界再編が行われ、関東と関西に10チームが集中していた球団所在地が北海道や東北へと拡大、また一時期消滅していた九州においても球団が再設立された。また嗜好の多様化により全国放送こそ少なくはなったものの地元ファンの取り込みに熱心となり、高度経済成長期以上の客入りを確保する球団も増え現在に至る。

現在のNPBの球団

1950年シーズンから2リーグ制を採っている。当初はセ・リーグ8球団、パ・リーグ7球団の計15球団が存在したが、現在は2リーグ各6球団の計12球団が所属している。
2021年現在、広域地方のうち四国地方を除く全地方に最低1球団プロ野球チームが所在している。
なお、球団名称については企業名をそのまま入れるのが通例になっており、2021年現在「地域名＋愛称」のみのチームは存在しない。

セントラル・リーグ

球団名	保護地域	本拠地球場	球団創設年度
読売ジャイアンツ	東京都	東京ドーム	1934年
阪神タイガース	兵庫県	阪神甲子園球場	1935年
中日ドラゴンズ	愛知県	ナゴヤドーム	1936年
東京ヤクルトスワローズ	東京都	明治神宮野球場	1950年
横浜DeNAベイスターズ	神奈川県	横浜スタジアム	1949年
広島東洋カープ	広島県	MAZDA Zoom-Zoom スタジアム広島	1949年

パシフィック・リーグ

球団名	保護地域	本拠地球場	球団創設年度
オリックス・バファローズ	大阪府	京セラドーム大阪	1936年
福岡ソフトバンクホークス	福岡県	福岡PayPayドーム	1938年
埼玉西武ライオンズ	埼玉県	メットライフドーム	1949年
北海道日本ハムファイターズ	北海道	札幌ドーム	1945年
千葉ロッテマリーンズ	千葉県	ZOZOマリンスタジアム	1949年
東北楽天ゴールデンイーグルス	宮城県	楽天生命パーク宮城	2004年