概要
外来種（がいらいしゅ）とは、本来生息していなかったある地域に人為的に移入されそこに定着した動植物を指す言葉である。一方で、元から生息しているものは在来種と呼ばれる。
生物は長年の進化の歴史を経て、その土地で他の種類の生物との安定した関係を築き生態系を作っていくものだが、外来種は既存の生態系のバランスを崩し、場合によっては在来種との交配によって遺伝子汚染を引き起こす。同様の生態的地位を占める在来種と競合して絶滅に至らせたり、大繁殖して在来種を食い荒らしたりして、その土地の生態系を単純化させる。ワニガメやセアカゴケグモなど、場合によっては人間にも直接的な被害を及ぼす場合もある。ただし、既に絶滅した在来種に近いニッチを占める外来種の増殖により、過去に近い生態系が疑似的に再現されることもある。
外来種として問題になるのは多くの場合外国産の種であることが多いが、北海道におけるカブトムシやゲンジボタルのように、本来その地域には生息せず、他の地方から移入されたとされる動植物も外来種として指定され、それらは主に国内外来種と言われる。
外来種とはあくまでも人為的に移入された生き物を指し、自然界の事象で外来の生き物がやってきた場合は定義上外来種にはあたらないが、人畜に害を及ぼす動物が漂着した場合は駆除されることがある（北海道本島から離島に泳いでやってきたエゾヒグマ、東南アジアから流れ着いた西表島のイリエワニなど）。
また、近年では外来種を取り扱った児童書も出版されている。
侵入経路
- 動物の場合 ペット用に持ち込まれた個体が逃げ出したり、捨てられたりするケース（あらいぐまラスカルのブームで輸入されたアライグマや甲虫王者ムシキングのブームで輸入されたヘラクレスオオカブトなど）の他、食用（ウシガエルなど）や毛皮（ヌートリアなど）等の生物資源として導入された生物が逃げ出したもの、害獣の駆除目的として野に放った生物が野生化したもの（ハブ対策として導入されたマングースなど）、放牧された生物が放置されそのまま野生化したケース(ヤギ、アナウサギ等)等が多い。
海外から日本に移入された外来種
五十音順
あ
アオウオ
アカウキクサ
アカカミアリ
アカボシゴマダラ
アカミミガメ
アザミウマ
アナウサギ
アフリカツメガエル
アフリカマイマイ
アメリカザリガニ
アメリカシロヒトリ
アメリカナマズ
アメリカミンク
アライグマ
アリゲーターガー
アルゼンチンアリ
アレチウリ
イエシロアリ
イヌ
イノブタ
ウォーキングキャットフィッシュ
ウチダザリガニ
ウリミバエ
オオカナダモ
オオキンケイギク
オオヒキガエル
オオマリコケムシ
オランダガラシ
か
カサネカンザシ
カダヤシ
カナダガン
ガビチョウ
カミツキガメ
カモンパ
カワヒバリガイ
キョン
クサガメ
グッピー
クマネズミ
グリーンアノール
コイ
コウライキジ
コキーコヤスガエル
コクレン
コナジラミ
さ
サキグロタマツメタ
サクラマス
シャンハイガニ
シュロ
シロアゴガエル
シロツメクサ
スイセン
スクミリンゴガイ
セアカゴケグモ
セイヨウミツバチ
セイヨウオオマルハナバチ
セイタカアワダチソウ
セイヨウタンポポ
ソウギョ
ソウシチョウ
た
タイリクスズキ
タイリクバラタナゴ
タイワンザル
タイワンスジオ
タイワンハブ
タイワンリス
ダンゴムシ
チチュウカイミドリガニ
チャコウラナメクジ
チャバネゴキブリ
チョウセンイタチ
ツマアカスズメバチ
ティラピア
トマトサビダニ
な
ナイルパーチ
ナガエツルノゲイトウ
ニジマス
ニューギニアヤリガタリクウズムシ
ヌートリア
ネコ
は
ハクレン
ハト
ハナガメ
ハリネズミ
ハルジオン
ヒアリ
ヒメジォン
ヒロヘリアオイラガ
フイリマングース
ブタクサ
ブラウントラウト
ブラックバス
ブルーギル
プレコ
ヘラクレスオオカブト
ボタンウキクサ
ホテイアオイ
ホンビノスガイ
ま
マダラロリカリア
マングローブヘビ
ミナミオオガシラ
ムネアカハラビロカマキリ
ムラサキイガイ
メダカ
モウセンゴケ
モウソウチク
や
ら
わ
ワカケホンセイインコ
ワニガメ
など。
日本で別の地域に定着している国内外来種
カブトムシ（北海道）
クニマス（西湖）
ゲンゴロウブナ（琵琶湖、淀川水系以外）
ゲンジボタル（北海道）
ツチガエル（北海道）
ナマズ（東日本）
ニゴロブナ（琵琶湖、淀川水系以外）
ニホンイシガメ（沖縄）
など。
日本から海外へ移出され問題になった外来種
アゲハチョウ
イタドリ
オオスズメバチ
オオハリアリ
カブトムシ
キオビクロスズメバチ
キヒトデ
クズ
コイ
ゴマダラカミキリ
ススキ
チガヤ
ニホンジカ
ヌマコダキガイ（日本ではレッドリスト入り）
ヒトスジシマカ
マメコガネ
ワカメ
など。
※タヌキに関しては、ヨーロッパで繁殖して問題になっている個体群はニホンタヌキとは別種のビンエツタヌキと考えられる。
関連条目
特定外来生物
在日(在日外国人)：日本の文化や風習、道徳を尊重せず我が物顔で振る舞う様は、時に『外来種(外来生物)』と揶揄される。諸外国における移民・難民問題も参照。
