生物の分類群を示す世界共通の名前で、ラテン語文法で表記される。18世紀の生物学者であるカール・リンネが提唱し体系化した。
学名の基本的な表記法は動物だけでなく、植物や原核生物などもすべて同じであるが、実際に学名を決めるための規約はそれぞれ異なる。「国際動物命名規約」と「国際藻類・菌類・植物命名規約」および「国際原核生物命名規約」がそれである。ウイルスは細胞性生物ではないため命名規約がないが、分類のために原核生物のルールを準用して学名が命名されている。
属と種
種の場合、現生人類（ヒト）の学名「Homo sapiens」というように、同属ほど近縁な生物種をまとめた「属名」と、そのうち特定の生物種を表す「種小名」を組み合わせた二名法である。これは特定の種を表す「種名」となり、属名は最初の1文字だけ大文字で、種小名は全て小文字。文献記載では、属名や種名をこのように斜体（イタリック字体）で特記されることが一般的。
- ヒトの場合は今は同じヒト属（Homo）の別種がいないので1属1種という扱いになるが、絶滅したネアンデルタール人は同属別種で、Homo neanderthalensis という学名がつけられている。
- 現在1属1種の生物は、他にもカブトムシ（Trypoxylus dichotomus）やサバクキンモグラ（Eremitalpa granti）やイチョウ（Ginkgo biloba）など多数ある。
- 逆に大きな属としてはレンゲソウ（Astragalus sinicus）などが分類されるゲンゲ属（Astragalus）のように3,000以上の種が属するものがある。
属全体を指すのに属名だけを単独で表記することはあっても、種小名だけ種を表記することはまずない。これは、属が違うと同じ種小名を使うことが認められているため、種小名だけだといずれの生物を指しているのかわからないからである。
- 甲虫の一種ヘラクレスオオカブト（Dynastes hercules）で有名な種小名 hercules は、蛾の一種ヘラクレスサン（Coscinocera hercules）にも使われている。
- ヤマシマウマ（Equus zebra）の種小名でシマウマの英語表記でもある zebra はクワガタムシの一種であるゼブラノコギリクワガタ（Prosopocoilus zebra）にも使われている。
- imperialis や elegans、japonica に至っては常用される種小名であり、様々な生物のグループで命名されている。
亜種
種がさらに亜種（subspecies）として区分できる場合、種名の後ろにさらに「亜種小名」を付けられる。この学名全体が特定の亜種を指す「亜種名」となり、三語名法で表記する（属名 種小名 亜種小名）、もしくは subspecies の略 subsp./spp. を種小名と亜種小名の間に挟んで表記する（属名 種小名 spp. 亜種小名）。そのうち同種の新しい亜種を定義するための基準となる亜種は、種小名と亜種小名が同じで、基亜種（原亜種、原名亜種）という。
- 前述したカブトムシ（Trypoxylus dichotomus）には Trypoxylus dichotomus septentrionalis（ヤマトカブトムシ）や Trypoxylus dichotomus takarai（オキナワカブト）などの亜種がいるが、基亜種は Trypoxylus dichotomus dichotomus（タイリクカブトムシ）である。
これも種小名と同様、属が違うと同じ亜種小名を使うことが認められているため、亜種小名だけを表記する事はない。
属より上位な分類群
学名といえば前述した属や種のイメージが強いが、属より上位な分類階級（科・目・綱・門・界など）にも学名が設けられる。ただしこれらの場合、学名は下位分類の併記（二名法）をせず、最初の1文字だけ大文字で、斜体をしないことで属名や種名と区別される。
前述したヒトを例にすると概ね次の通り。
語源
文法こそラテン語だが、語源はラテン語にこだわる必要はないため、別言語の言葉に由来する学名(古生物であれば発見場所の言語や地名が使われる事がよくある)も多く、果てはサブカルチャー由来のものもいる。
- 日本語由来のものでは Nipponia nippon（トキ）や Gojirasaurus quayi（ゴジラサウルス）、Fukuisaurus（フクイサウルス）などが挙げられる。
- 日本語以外では中国語の「冠龍」由来の Guanlong（グアンロン）や、語源（Albert）はドイツ語であるアルバート州由来の Albertaceratops（アルバータケラトプス）、ハリー・ポッターに登場する架空のクモ「アラゴグ」由来の Lycosa aragogi（コモリグモの一種）などが挙げられる。
特定の人物に敬意を表して、命名者がその名前を学名に織り込む場合も少なくない。これを献名という。
- 日本人の名前由来のものでは Futabasaurus suzukii（フタバサウルス・スズキイ）、Dorcus titanus yasuokai（スマトラオオヒラタクワガタ）などが挙げられる。
- 英語では著名な生物学者チャールズ・ダーウィン由来の種小名（時には亜種小名）darwini が様々な生物のグループで命名される。
一方、命名者が自分の名前を学名に織り込むことは基本的にはなく、Linnaea borealis（リンネソウ。1753年にカール・リンネが自分の名前を学名に織り込んで記載）のような早期のごく稀の例外しかない。
読み方
決まった読み方はなく、学名自体のスペルさえあっていればどのようにカタカナ転写や発音をしても構わない。
- Tyrannosaurus は「ティラノサウルス」の方が一般的であるが、「ティランノサウルス」でも「チラノサウルス」でもよい。
- 前述した Dynastes hercules の和名は種小名由来で、それがヘラクレスオオカブトになったりヘルクレスオオカブトになったりする。
「Homo sapiens Linnaeus, 1758」ないし「Homo sapiens L.」のように、学名の最後には命名者（苗字かその略）や学名公表年を併記される場合もある。この文面全体がしばしば「学名」と紹介されることがあるが、命名者と学名公表年は学名の一部ではない。また、「ホモ・サピエンス」という表記はあくまで学名のカタカナ転写であり、学名そのものではない。
「学名」という文面から「学術的な名称」という漠然としたイメージを与えるからか、特定の言語での正式の生物名（日本語では和名）が誤って学名と紹介されることもある。また、同じ理由でときおり「学術名」と呼ばれているが、これは「学問で用いられる名称全般」を意味する言葉であり、学名とは同義ではない。
学名は1つに決められるべきであるが、種類の分け方は研究者によって見解が異なる場合があり、これにより同一の種や分類群が複数の学名を与えられた場合もしばしばある。これをシノニム（異名、同物異名）という。この状況を判明した場合は先取権に従い、先につけられた方は正しい学名（古参異名、シニアシノニム）、後につけられた方は無効の異名（新参異名、ジュニアシノニム）とされる。
- アサガオの正しい学名 Ipomoea nil（1797年に記載）とそのジュニアシノニム Pharbitis nil（1833年に記載）。
ただし一般的な文脈での「シノニム」は、単にジュニアシノニムを指す場合が多い。
また、種の場合は所属する属が変えられた時、古い分類による命名の方をシノニムと呼ぶことが多い。
- 前述したカブトムシ（Trypoxylus dichotomus）には、サビカブト属（Allomyrina）に分類された頃の Allomyrina dichotoma / Allomyrina dichotomus や、タマオシコガネ属（Scarabaeus）に分類された頃の Scarabaeus dichotomus といった古い分類による命名があって、これらが Trypoxylus dichotomus のジュニアシノニムともされる。
この場合でも前述の公表年は変更されない。前述の「
Trypoxylus dichotomus」は2000年代に変更された学名だが、（Trypoxylus dichotomus Linnaeus, 1771)という表記が使われる。
近年、現生する生物（特に植物）については遺伝子などの分子系統解析により分類の判断がされるようになってきたが（分類を分子系統学的な手法だけで決めることには異論もある）、化石でしか残っていない古生物は遺伝子解析のしようがないので、研究者により判断が大きく分かれることが多い。
動物の学名は、地域の言語にもよるが専門家以外にはあまり使われることがない。通称名に比べ長いことと、名付け方が直感的ではないためであろう。
なお、古生物の場合は日本語のティラノサウルス（Tyrannosaurus）やアノマロカリス（Anomalocaris）のように、学名（特に属名。図鑑などでも属までしか記載されない事が多い）の音訳を通称として使われるのが一般的な言語もある。
動物の学名に特徴的なものとして「Gorilla gorilla」(ニシゴリラ）のように属名と種小名が同じ反復名（tautonym）がある。反復名は植物では許容されていない。
動物とは対照的に、一般の人にもなじみのある学名が多くある。アネモネ（イチリンソウ属 Anemone）、ロベリア（ミゾカクシ属 Lobelia）、コルチカム（イヌサフラン属 Colchicum）、デルフィニウム（オオヒエンソウ属 Delphinium）、ゼラニウム（フウロソウ属 Geranium）...など、属に和名があってもあまり使われず、学名のカタカナ転写で一般に呼ばれる植物は数多い。
しかし園芸分野で使われる学名は古い分類に基づくシノニムが多く、現行の分類と一致しているとは限らない。一般にゼラニウムと呼ばれる草花は実際にはペラルゴニウム（テンジクアオイ属 Pelargonium）の一部の種であり、しかも店によっては「ペラルゴニウム」の名も併用していたりするため非常にややこしい。
また、植物では二名法の種名の後ろにさらに変種（variety を略して var.）の名を付けて表記されることもある。これは野菜や果物などの園芸植物で特に多く見られる。動物命名規約では種小名の後ろにつけられる階級は亜種のみが認められており、変種名の表記は認められていない。
原核生物（細菌と古細菌）の分類は、動物や植物に比べて難しい問題を多くはらんでいる。形態が似たようなものも多く外形で分類することが難しいことと、培養できる種が限られていること、そして遺伝子の水平伝播といって、異なる系統の細菌から遺伝子を獲得することがよくある（動物や植物でも遺伝子の水平伝播はないことはないが限定的）ことなどである。
ヘリコバクター・ピロリ（Helicobacter pylori）やビブリオ・バルニフィカス（Vibrio vulnificus）など、一部の病原菌は学名のカタカナ転写の知名度が高い。
シアノバクテリア（藍藻）は原核生物だが、かつて藻類として扱われていた名残りから国際藻類・菌類・植物命名規約で取り扱われている。
SF作品（稀にファンタジー作品にも）では架空の生物種に設定される事があり、フレーバーテキストとして機能している。
あくまでもフレーバーテキスト目的の命名であるため、現実の学名と違って詳細なルールが決められているというわけではない。日本語であればアルファベットではなくカタカナ表記にされ、それっぽさを出すために「〇〇ザウルス(トカゲのラテン語表記であるSaurusが元と推測されるため、実際にはサウルスの方が正確と言える)」や「〇〇・〇〇ス」というネーミングが付けられる傾向にあり、中には明らかに日本語文章の捩りや和名方式のものも見受けられる。
東宝怪獣
| 出典 | 怪獣名 | 学名 |
|---|---|---|
| ゴジラの逆襲 | アンギラス | アンキロサウルス |
| 大怪獣バラン | バラン | バラノポーダ |
| ゴジラ×メガギラスG消滅作戦 | メガニューラ | メガニューラ・ルイザエ |
| GODZILLA-ゴジラ- | ゴジラ | タイタヌス・ゴジラ |
| ゴジラ・キング・オブ・モンスターズ | カマソッソ | タイタヌス・カマソッソ |
| - | スキュラ | タイタヌス・スキュラ |
| - | ティアマト | タイタヌス・ティアマト |
| - | メトシェラ | タイタヌス・メトシェラ |
| - | モスラ | タイタヌス・モスラ |
| - | ヤマタノオロチ | タイタヌス・ヤマタノオロチ |
| ゴジラS.P | カマンガ | クモンガ・ファルシペス |
| - | クモンガ | クモンガ・サイトーデス |
| - | ゼンブンガ | クモンガ・ウルティマ |
| - | ハネンガ | クモンガ・アラートゥス |
| GODZILLAvsKONG | コング | タイタヌス・コング |
| - | ダグ | タイタヌス・ダグ |
| - | ワーバット | ベラム・ヴェスペルティリオ |
その他
| 出典 | 種族名/個体名 | 学名 |
|---|---|---|
| R-TYPE | ドプケラドプス | ドプケラドプス・マットウシス |
| ゼノギアス | ウーキィ族 | ドテスカチュチュポリン |
| テイルズオブエターニア | クィッキー | ポットラビッチヌス |
| ドンキーコング3 | バナナバード | ゴルダス・フラッタース |
| にじさんじ | まめねこ | ハツガソライロマメネコ |
| のび太の創世日記 | 昆虫人 | ホモ・ハチビリス |
| バトルスピリッツソードアイズ | 疾風丸 | コルガノオオゾラノツバサ |
| ピクミン | イヌムシ科 | oculus kageyamii |
| マリオシリーズ | ヨッシー | T.ヨシザウルス・ムンチャクッパス |
| ゼルダの伝説ムジュラの仮面 | ガロ | ガロ・ローブ |
| リヴリーアイランド | ムシチョウ | phoenix penni-non |
| ルーニー・テューンズ | ロード・ランナー | ハヤイッテ・シンジラレンス(他多数) |
| - | ワイリー・コヨーテ | ニククッテ・ガッツキス(他多数) |
| ONEPIECE | 象主(ズニーシャ) | ナイタミエ・ノリダ象 |
| ジュラシック・ワールド | インドミナス | Indominus Rex |
随時追加希望
実在する学名の扱い
神話の場合、実在の生物を基にした星座は英語名が該当生物の学名（もしくはその一部）とほぼ同じのケースが多いが、そのほとんどが元から該当生物を指している語（主にラテン語や古代ギリシア語）である。
- ヒツジ（Ovis aries）と牡羊座（Aries）、ウシ（Bos taurus）と牡牛座（Taurus）、サソリ（Scorpiones）と蠍座（Scorpio）、イチョウガニ属（Cancer）と蟹座（Cancer）、ノウサギ（Lepus）とうさぎ座（Lepus）など。
近代のフィクション作品では、実在する学名がそのまま導入されることは一般的ではないが、元になった生物の学名がキャラクター名に取り込む事が多い。
- ライオンを元にしたキャラクターにはライオン（Panthera leo）の種小名 leo（レオ）が名前に使われている事が多い。
- ティラノサウルス（とりわけ Tyrannosaurus rex。属名は頭文字だけ取ってT・レックスと呼ばれる事もある）を元にしたキャラクターも、同じく種小名である rex（レックス）が名前になる事がしばしばある。
- 昆虫などの虫がモチーフの「王様戦隊キングオージャー」では、登場人物名の多くが昆虫の学名由来の部分がある。
一方、実在する生物をそのままテーマにした作品であれば、その学名まで忠実に導入されるものもある。
- 例えば「甲虫王者ムシキング」では学名が明記(「Allomyrina」なら「アロミリナ属」など属名のカタカナ表記に属を付けて表示される)されるだけでなく、属名が同じ虫同士だと相性が良くなるシステムも存在する（ただし、攻略本では「学名や外見が似ている」という曖昧な表記になっている。その割に種小名や亜種名は意味をなさない）。そして稼働当時の旧分類により、カブトムシの学名が一昔前の Allomyrina dichotoma となっている。一方、オオクワガタは属名は変わらなかったため学名の変更に伴いカードの記載も変えられている。
- ただし、実在する生物を扱っている故に属名ごとの格差が大きい。「Allomyrina」「Dynastes」「Prosopocoilus」「Dorcus」といった属名の虫は多いのに「Augosoma」「Strategus（に限らずサイカブト族全般）」「Chiasognathus」「Homoderus」などの属名の虫は1種しか登場していない。
- また、本作では種小名や亜種小名が和名の一部になっていれば、それが略称として用いられて甲虫名を呼ぶ事もある。ヘルクレスオオカブトの基亜種(この亜種は種小名は記載されていない。また出身地に基亜種のいないブラジル一カ国しか記載されていない) Dynastes hercules hercules なら「ヘルクレス」、もう1つの亜種である Dynastes hercules ecuatorianos なら「エクアトリアヌス」など。
- この略称に関しては登場するカブトムシ・クワガタムシ間でも「別種なのに種小名が同じ」組み合わせがある。「マンディブラリスフタマタクワガタ」と「マンディブラリスミツノカブト」は両者とも種小名が「mandibularis」。前者の属名は「Hexarthrius」、後者の属名は Strategus 。
- 本作で「マンディブラリスフタマタクワガタ」が前述の略称名として「マンディブラリス」表記になっている為、前述した「いずれの生物を指しているのかわからない」という事態が起こっている。そもそもこの種小名の生物も多くいるわけだが…
- なお、こちらの固有名詞付き虫は個体名をアルファベットにしたものが学名と一緒にカードに記載されている。「キング」なら「King (Allomyrina dichotoma)」、「カブト丸」なら「Kaboto-maru (Allomyrina dichotoma)」など。
- 「アニマルカイザー」では学名が導入されないが、カードには固有名詞付き動物含めしっかり記載されている。なお、こちらにもカブトムシが登場するが、こちらは登場時には既に変更されていたため、Trypoxylus dichotomus と記載されていた。
- 「古代王者恐竜キング」ではジャークアーマー恐竜の固有名詞に元になった恐竜のシノニム・無効名・疑問名が固有名詞が使われた。
- この作品の恐竜は一部は種小名が記載されている恐竜がいるが、その場合は上記の「T・レックス」同様、属名のアルファベット表記の頭文字に種小名のカナカナ表記を付けている。アロサウルス アトロクスなら「A・アトロクス」など。
